敖包祭祀数百年来，当地牧民始终敬仰、供奉着本家族或部落传承的敖包。草原上每年都要举行多层面的敖包社祭活动。

　　自古以来，蒙古民族通过一年一度的隆重祭祀敖包"神灵"的形式，传承和发扬光大人与自然和谐的道德理念，使人们的生态道德意识进一步统一规范，人人都把敬畏生命、珍爱生态、和谐自然当作义不容辞的天职。

　　每年阴历五月十三，是格根塔拉草原敖包传承已久的大型祭日，整个祭祀仪式依然按照传统礼仪进行。头一天，要对敖包进行全面装饰，将象征敖包魂魄的苏鲁锭的古格力（蒙古语马鬃）、敖包顶上的鲜树枝、五彩拉链等装饰全部更新。祭日这天，世代祭祀这座敖包的牧民穿着节日盛装，扶老携幼，一大早就从四面八方涌来，把从家带来煮熟的全羊和奶制食品摆在祭祀台上，然后每家的户主焚香举灯，并在彩色拉链上拴上憧憬美好吉祥的哈达，意味着向敖包神灵报道。

　　旅游中心所祭祀的"格根查干敖包",原本属于本土牧民祭祀的古老部落扎萨克敖包，曾经由博教（萨满教）大师开光，后来的佛教高僧对这座敖包又融入了符咒，实属拥有"灵性"的正宗敖包。旅游中心为了充分展示远古敖包文化的魅力，按照蒙元时期形成的敖包规则予以拓展，即以故有的敖包为核心，由12座统一的小敖包，分布于规则的圆周线上，簇拥着主体敖包。蒙古族历来崇尚数字的"13",认为这个数字既是成功的起点，又是万事大吉的象征。这种由"13"组合而成的敖包寓意深刻，"10"是一个整数，有整合之意，"3"是一个全数，即代表着天、地、人的统一体，象征着完美无缺的苍天之力。源于远古时期的博教，根据其长生天学说"上苍有99重天，下有人间轮相属年和谐共存"之理念，主体敖包的石壁上制有祭典长生天的99盏灯座，体现着其三元结构的完美与蒙元时期正宗敖包的风采和神威。

　　祭祀仪式结束时，所有民众举着招福桶，继续呼喊"呼瑞艾",按顺时针方向绕敖包转三圈，意思是敖包神灵使他们与天地取得了心灵上的沟通，再次亲近了大自然，示意感激之情。

　　祭祀仪式开始后，一边由博教大师击鼓跳跃出场，吟唱博教传承的祭天诗文，祈求长生天恩泽于大地富庶生机、远离邪恶，一边由喇嘛们奏乐诵其藏经"纳木达格桑",祈祷天下安泰、福满人间。此刻，牧民们无比虔诚地向天地万物神灵祈求：风调雨顺、人畜兴旺，而且频频举起手中的招福桶或替代食品，顺时针方向摇晃着，齐声高呼"呼瑞艾"（天赐吉祥福禄惠顾于你我他和天下万物生灵）。